De hoofdontwikkelaar van Assassin's Creed Shadows verzekert spelers dat de focus op een enkele hoofdrolspeler hun ervaring niet aanzienlijk zal beïnvloeden. De game bevat twee speelbare personages: NAOE, een vrouwelijke shinobi en Yasuke, een historische Afrikaanse samurai, wiens inclusie de discussie voor de release heeft gegenereerd.
Er ontstonden bezorgdheid dat het prioriteren van één personage zou kunnen leiden tot gemiste verhaalelementen of gameplay. Creatief directeur Jonathan Dumont ging over deze zorgen en beschrijft zijn eigen evenwichtige aanpak: hij schakelt tussen personages, speelt 3-5 uur met één voordat hij 2-3 uur naar de andere schakelt.
Dumont verduidelijkte echter dat spelers niet significant worden benaderd door één personage te begunstigen. Terwijl elke hoofdrolspeler unieke openingssequenties en persoonlijke verhaallijnen beschikt, past het verhaal van de game zich aan aan de keuze van de speler. Hij moedigt spelers aan om te spelen als hun favoriete personage:
"De kerngameplay blijft consistent, ongeacht je keuze. Je zult niet cruciale plotpunten missen door je op één te concentreren. Elk personage heeft zijn eigen introductie en persoonlijke missies, maar het algemene verhaal past zich aan je voorkeur aan. Speel je favoriet; het verhaal Volg het voorbeeld. "
